Esta linha dedica-se a veículos autónomos submarinos, de superfície e aéreos. O trabalho desenvolvido tem envolvido a utilização de UUV em guerra de minhas, utilização de tecnologia de robótica em Busca e Salvamento, veleiros autónomos e sistemas de aterragem de UAV em meios navais. Tem também, em conjunto com a linha de processamento de sinal, feito algum trabalho no encaminhamento de mensagens em redes ad-hoc (constituídas por veículos autónomos).