O Centro de Investigação Naval (CINAV) é o orgão da Escola Naval que, sem prejuízo das competências do Instituto Hidrográfico, tem por missão coordenar das atividades de investigação e desenvolvimento da Marinha, assim como prestar apoio, promover e participar nas atividades de investigação e desenvolvimento da Escola Naval.

No contexto destes dois vetores de atuação, e de acordo com o Regulamento da Escola Naval, o CINAV tem ainda por missão:
- Promover a colaboração e o intercâmbio científico com instituições e investigadores de outras instituições universitárias, científicas, tecnológicas e empresariais;
- Promover a difusão da cultura científica e tecnológica;
- Fomentar a publicação e difusão dos resultados dos trabalhos dos seus investigadores.

A coordenação das atividades de investigação efetuada pelo CINAV é exercida em articulação com o Centro de Investigação e Desenvolvimento do Instituto Universitário Militar, tendo em vista o desenvolvimento das linhas de investigação nas áreas de interesse fundamentais da segurança e defesa nacional, de acordo com as especificidades próprias do CINAV.